'99第31回全日本大学駅伝関東地区選考会
大学別順位（確報)
(注)亜大と明大の個人記録に入り繰りがあり、修正しました。その結果、専大と亜大、明大と國學院の順位も入替っています。（99.6.14)
| 1 | 中大 | 4.01.55.45 |
| 2 | 早大 | 4.02.32.00 |
| 3 | 法大 | 4.02.40.99 |
| 4 | 日大 | 4.02.49.90 |
| 5 | 東海大 | 4.03.09.40 |
| 6 | 大東大 | 4.03.21.53 |
| 以上6校推薦 | ||
| 7 | 帝京大 | 4.03.34.87 |
| 8 | 東洋大 | 4.03.46.13 |
| 9 | 関東学院 | 4.04.41.21 |
| 10 | 専修大 | 4.07.18.01 |
| 11 | 亜大 | 4.07.51.39 |
| 12 | 平成国大 | 4.07.52.40 |
| 13 | 国士館大 | 4.08.54.78 |
| 14 | 日体大 | 4.09.05.05 |
| 15 | 明大 | 4.09.25.39 |
| 16 | 國学院大 | 4.10.25.45 |
| 17 | 創価大 | 4.14.19.32 |
| 18 | 筑波大 | 4.17.55.06 |